Novell a vivement critiqué une étude sponsorisée par Microsoft qui conclut que Suse Enterprise Linux n'est pas fiable et difficile à maintenir par rapport à Windows Server. Novell estime que l'étude n'a pour but que de créer la confusion sur le marché. L'étude a été menée par Security Innovation, un partenaire de Microsoft. Elle conclut qu'un administrateur Linux prend environ 2/3 de temps en plus qu'un administrateur Windows pour répondre à une demande des utilisateurs. L'étude se concentre notamment sur la migration de Windows Server 2000 vers 2003 et de Suse 8.0 vers Suse 9.0. elle pointe aussi des problèmes d'interopérabilité sous Linux. Pour Kevan Barney, un porte parole de Novell, Les problèmes d'interopérabilité entre OS et applications pointés par l'étude sont démesurés par rapport à la réalité et il ne compense pas les problèmes de sécurité que peuvent poser les OS Windows. De même Novell estime qu'il est impossible de comparer le nombre de patches de sécurité Linux et ceux de Windows, du fait du nombre d'applications (mail, pare feu, base de données...) inclus avec les distributions Linux. Barney critique aussi le jugement positif porté par Security Innovation sur la stratégie "Integrated innovation" de Microsoft, en jugeant que c'est cette stratégie qui est la cause des principaux problèmes de sécurité rencontrés avec Windows.