Alors qu'une première bêta du système de gestion de fichiers du prochain Windows était déjà sortie, Microsoft change de stratégie : WinFS ne sera plus ni une composante (comme il devait l'être à l'origine) ni une extension de Windows (comme il en était question depuis mars 2005). Chef du projet, Quentin Clark annonce sur son blog que les technologies étudiées au sein du projet WinFS seront en fait disséminées dans d'autres projets, en premier lieu Katmai, la prochaine base de données SQL Server, et le service universel d'accès aux données ADO.Net 3. A l'origine, WinFS était présenté comme le système de fichier de Longhorn (nom de code de Vista), et il devait permettre de gérer ses fichiers à la manière de données dans une base relationnelle : possibilité de créer des dossiers virtuels thématiques grâce à l'utilisation de pointeurs vers les données, recherche améliorée grâce à l'emploi de métadonnées... Face aux commentaires saignants publiés sur le blog de Quentin Clark, Alain Le Hégarat, responsable marketing .Net pour Microsoft France, relativise la portée de l'annonce : « Du point de vue de l'usage qu'on promettait aux utilisateurs, cela ne change rien : les fonctions sont délivrées en grande partie dans Vista par Windows Search. »