Rhône-Alpes : Le GCS Auragen se dote d'un supercalculateur

Le séquençage de génomes individuels a sa place dans le parcours de soins de patients atteints de certaines pathologies, notamment des maladies génétiques et des cancers. Cette analyse vise à une prise en charge autant diagnostique que thérapeutique. La France a lancé un plan « France Médecine Génomique 2025 » dans le cadre duquel le GCS (Groupement de Coopération Sanitaire Auvergne Rhône Alpes Génomique) Auragen [voir encadré] a décidé de se doter du supercalculateur nécessaire à cette analyse génomique individuelle afin de détecter des variations génétiques présentes chez les patients. A terme, la plate-forme traitera 2,5 Po/an, depuis le séquençage de l'ADN jusqu'à la production de l'analyse.

Trois prestataires co-contractants ont été retenus : Atos pour l'intégration, Eolas (groupe Business & Décision) pour l'hébergement des données de santé, et A2COM pour l'infogérance du système. L'infrastructure utilise quant à elle des technologies Dell EMC. Les utilisateurs métiers (biologistes, généticiens et bio-informaticiens) ont été largement consultés au cours de la phase de conception. Les trois partenaires co-contractants construisent, exploitent et maintiennent l'ensemble de la plate-forme.