Pour conserver son identité et "au nom de la philosophie du logiciel libre", MandrakeSoft refuse de participe à l'initiative United Linux. Lancée au printemps, l'alliance United Linux a pour but le développement d'une distribution Linux unifiée. Elle rassemble les éditeurs de distribution Caldera, SuSE, TurboLinux et Conectiva.

Dans une FAQ (Frequently Asked Questions) publiée sur son site, l'éditeur MandrakeSoft justifie son opposition à cette initiative : selon l'éditeur français, "United Linux n'est que l'effet d'une concentration du marché. [...] MandrakeSoft n'aurait aucun intérêt à se joindre à cette initiative. Cela pourrait conduire à la disparition de nombreuses fonctions qui font le succès de Linux Mandrake". MandrakeSoft fait également remarquer que les quatre éditeurs impliqués dans United Linux affichent aujourd'hui des parts de marché inférieures à celles de Linux Mandrake.

Ce dernier avis est toutefois à manier avec des pincettes. Les 4 membres de United Linux sont en effet plutôt connus pour leurs distributions pour serveurs, alors que MandrakeSoft vend essentiellement des distributions pour poste client.