Alors que le SP1 de Vista est censé corriger des problèmes d'incompatibilité entre l'OS et plusieurs applications utilisées notamment en milieu professionnel, l'éditeur de Redmond publie une liste de logiciels qui fonctionneront mal, voire pas du tout, avec le Service Pack. Parmi les applications posant problème figurent une majorité d'outils dédiés à la sécurité. C'est le cas de produits signés BitDefender, Jiangmin, Trend Micro, Zone Alarm et Fujitsu. Tous les logiciels de ces éditeurs recensés par Microsoft (voir tableau ci-dessous) refuseront d'être exécutés tant que l'utilisateur n'aura pas appliqué de correctif, généralement déjà disponible, ou installé une version plus récente que celle entrant en conflit avec Vista. Le groupe de Steve Ballmer présente en outre une liste d'outils qui subiront une perte de fonctionnalité après l'installation du SP1. Aux côtés du pare-feu de Rising prennent place TimesReader - qui permet de lire le New York Times hors connexion - et ZENworks Configuration Management de Novell, éditeur qui a signé, en novembre 2006, un vaste accord d'interopérabilité avec Microsoft.