Imaginer des solutions fusionnant l’IA et les data sciences à destination de la recherche pharmaceutique. C’est le thème d’un hackathon organisé par Margo, un groupe de conseil IT spécialisé dans les missions à haute complexité, et l’association IA de l’école d’ingénieurs publique Télécom Paris. Qubit Pharmaceuticals, une entreprise parisienne spécialisée dans la simulation moléculaire ainsi qu’IBM France sont également associés à l’événement. L’objectif : mobiliser des ressources sur le sujet de la prédiction de la toxicité moléculaire afin d’éviter des effets secondaires graves. Pendant trois jours, du 23 au 25 mai 2025 plus de 70 étudiants présélectionnés de Télécom Paris se rassembleront pour développer des modèles permettant de détecter la toxicité cardiaque de molécules. L’idée est de concentrer les efforts de recherche sur les composés les plus prometteurs pour réduire significativement les délais et les coûts de développement.

Dans cette optique, les étudiants travailleront sur un jeu de données de 10 873 molécules fourni par Qubit Pharmaceuticals, Ils exploiteront des descripteurs chimiques et des empreintes moléculaires (1024 à 2048 bits), avec la liberté d’appliquer des approches variées : statistiques, machine learning, deep learning ou théorie des graphes. Encadrés par des spécialistes des entreprises organisatrices, les participants auront accès aux outils professionnels IBM Watson Studio et Watsonx.ai, et seront soutenus par du coaching technique tout au long du week-end afin d’explorer, tester et optimiser leurs modèles. Les solutions seront évaluées sur deux critères clés : d’un côté, l’exactitude globale (ACC), une métrique qui mesure la précision du modèle de prédiction. De l’autre, l’exactitude sur les 25 % de prédictions les plus confiantes (ACC25), un indicateur évaluant la performance des modèles sur les prédictions jugées les plus fiables.

Trois ensembles de tests distincts

Les modèles seront testés sur trois jeux de données : d’abord, sur un ensemble issu d’un article scientifique de référence (soit 700 molécules) pour servir de base de comparaison standard. Les évaluations s’effectueront aussi sur la sélection de molécules diverses par Qubit Pharmaceuticals (500 molécules) afin d’évaluer les modèles sur une variété chimique plus large ainsi que sur la constitution de structures moléculaires inédites. Un jury départagera et récompensera les solutions les plus innovantes.

Il s’agit du second hackathon organisé cette année par Margo, IBM et Qubit Pharmaceuticals dans le but de faire faire progresser l’innovation pharmaceutique en s’appuyant sur l’intelligence artificielle. En janvier 2025, une compétition axée elle aussi sur la détection de la toxicité moléculaire avait mis en lice 32 étudiants de l'association Binet IA de l'école Polytechnique.